历经原安徽医学高等专科学校培训部、成人教育管理办公室的多年发展，2020年9月，原安徽医学高等专科学校继续教育学院挂牌成立。随着学校升格为医学本科院校，2025年6月更名为安徽第二医学院继续教育学院，与挂设在学校的安徽省卫生职工培训中心办公室、安徽省全科医学培训中心办公室合署办公。学院是学校组织开展高等学历继续教育和非学历教育培训的主要办学单位，也是学校老年大学、自考助学服务中心和职业技能鉴定中心挂靠单位；学院还是安徽省职业与成人教育协会职业与非学历教育培训委员会执行秘书长单位。

安徽第二医学院继续教育学院是学校服务地方经济社会发展的重要渠道，是建设全民终身学习的学习型社会、学习型大国的重要桥梁，也是学校加快推进高质量发展，全力建成高水平应用型医学本科院校，建设“美好安徽”“健康安徽”的重要组成部分。主要开展高等学历继续教育和以高等职业院校教师素质提高培训、全科医生培训、全科医学师资培训及以全科医生为重点的基层卫生健康机构从业人员岗位能力提升继续教育培训等为主的非学历教育培训工作以及高等教育自学考试助学服务、面向校内毕业生开展职业技能等级认定及面向校内、校外开展老年教育培训等工作。

学院开展的高等学历继续教育在传承中创新，在创新中发展，在发展中不断壮大。学院始终坚持把办学质量放在首位，结合成人高等教育学生知识水平差异大、地域分布广、学习地点和时间较分散、工学矛盾突出等特点和实际情况，教学采用线上和线下相结合的方式进行。目前开设有临床医学、护理学、口腔医学、医学检验技术、医学影像技术、药学、老年保健与管理等七个成人教育（高起专）专业。

学院的非学历教育培训以服务合作为纽带和集聚平台，已组建了一支可服务卫生健康领域各类培训需求的专业化培训师资队伍，依托本校及全省乃至全国知名高校、政府、企业、行业雄厚的师资力量，常年自主研发主办、接受委托举办各类培训与研修项目。在全科医生培训、全科医学师资培训、基层卫生健康各专业从业人员服务能力提升继续教育培训、高等职业院校教师素质提高计划国家级培训和省级培训等领域已形成品牌特色，累计培训7万余人次，具有一定的区域影响力和良好口碑。

新时代，新征程，安徽第二医学院继续教育学院将继续全面贯彻落实党的教育方针，紧紧围绕学校应用型本科院校建设目标，坚持“地方性、应用型”办学定位，以党建促发展，以发展强党建，进一步优化办学结构，不断加快转型发展，努力提高办学质量和服务水平，明确目标，扩大办学规模，强化制度管理，加强工作作风建设，为把我校建设成为办学特色鲜明、区域影响显著的高水平应用型医学本科院校、加快推进现代化五大发展美好安徽建设、积极构建我国终身教育体系和学习型社会作出应有贡献。（2025年6月更新）